Практикум 3

Структура в целом

В базе данных PDB идентификатору 7FRK соответствует белковый комплекс PTP1B с Z30820160. PTP1B (Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1) относится к классу белков, если быть точнее — белков-гидролаз; состоит из 1 полимерной цепи A, и, соответственно, идентичных цепей нет. Эта же цепь является мономером макромолекулы. В одну биологическую единицу белка входит одна цепь A.

Отдельные цепи

Данная макромолекула относится к человеческому организму (Homo sapiens), экспрессия производилась в Escherichia coli.

Uniprot_id: P18031
Название: Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1 (PTP1B).

Функция: выступает регулятором ответа на накопление неправильно свернутых белков в эндоплазматическом ретикулуме (unfolded protein response). Осуществляет дефосфорилирование EIF2AK3/PERK, тем самым инактивируя протеинкиназную активность EIF2AK3/PERK. Может играть важную роль в сигнальных каскадах, индуцированных CKII и p60c-src. Также может регулировать сигнальный путь EFNA5–EPHA3, который модулирует клеточную реорганизацию и межклеточное отталкивание. Кроме того, может участвовать в регуляции сигнального пути рецептора фактора роста гепатоцитов посредством дефосфорилирования MET.

Катализируемая реакция:
O-phospho-L-tyrosyl-[protein] + H2O = L-tyrosyl-[protein] + phosphate

Относительно референса из Uniprot в последовательности мутаций обнаружено не было. Модифицированные аминокислотные остатки также отсутствуют.

Малые молекулы

  1. JFP (N-(4-methyl-1,3-thiazol-2-yl)propanamide): JFP.pdb
  2. TRS (2-amino-2-hydroxymethyl-propane-1,3-diol): TRS.pdb