|
При помощи функций программы RasMol исследованы нековалентные контакты лиганда циклотетраметаванадата V40_2 с его ближайшим окружением в белковой молекуле BtuD. В таблице представлены данные о найденном окружении лиганда с учетом данных о длине значимых нековалентных связей в биополимерах (~3.5 ангстрем).
Участок Btud |
Контактирующие атомы |
Расстояние (А) |
Тип связи |
GLY36 |
(3) OH - NH2 |
2,63 |
H-bonds |
ALA37 |
(1) OH - NH2 |
2,79 |
H-bonds |
ASN35 |
(4) O - Cb |
2,9 |
Hydrophobic |
LYS39 |
(0) O - CE |
3,04 |
Hydrophobic |
GLY38 |
(11) O - CA |
2,9 |
Hydrophobic |
THP41 |
(10) O - NH2 |
2,56 |
H-bonds |
THP41 |
(10) O - OG1 |
2,5 |
H-bonds |
|
Молекула лиганда (циклотетраметаванадат)
Лиганд в окружении атомов белка
|