Факультет Биоинженерии и биоинформатики

Контакты

Работа с программой RasMol


 

   При помощи функций программы RasMol исследованы нековалентные контакты лиганда циклотетраметаванадата V40_2 с его ближайшим окружением в белковой молекуле BtuD. В таблице представлены данные о найденном окружении лиганда с учетом данных о длине значимых нековалентных связей в биополимерах (~3.5 ангстрем).

Участок Btud
Контактирующие атомы
Расстояние (А)
Тип связи
GLY36
(3) OH - NH2
2,63
H-bonds
ALA37
(1) OH - NH2
2,79
H-bonds
ASN35
(4) O - Cb
2,9
Hydrophobic
LYS39
(0) O - CE
3,04
Hydrophobic
GLY38
(11) O - CA
2,9
Hydrophobic
THP41
(10) O - NH2
2,56
H-bonds
THP41
(10) O - OG1
2,5
H-bonds



Молекула лиганда (циклотетраметаванадат)


Лиганд в окружении атомов белка

Главная страница             


© 2003. ФББ МГУ им. М.В.Ломоносова