Множественное выравнивание

← Вернуться обратно

Muscle и GeneDoc

Маленькие дельта-антигены (small delta antigens), найденные в банке SRS, я сохранил в формате fasta и выровнял при помощи программы muscle. Ниже приведен вид выровненных последовательностей в текстовом редакторе и GeneDoc соответственно.

sequences in mousepad sequences in genedoc

Разумеется, просматривать пептидные последовательности намного удобнее в специализированной программе.

Выровненные последовательности есть в форматах FASTA и GeneDoc.

Выравнивание набора гомологов KAD_BACSU

Несмотря на то, что я старался выбрать последовательности из как можно более отличающихся классов бактерий и с не самой большой идентичностью, они все равно оказались очень сходными, из чего можно сделать вывод о большой консервативности этого фермента и, следовательно, его ключевом участии в метаболизме бактерий.

Выровненные последовательности есть в форматах FASTA и GeneDoc.