ID | AC | Итераций | Для первой итерации | Для последней итерации | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Находок выше порога 0.005 | Худшее E-value выше порога | Лучшее E-value ниже порога | Находок выше порога 0.005 | Худшее E-value выше порога | Лучшее E-value ниже порога | |||
MINC_ECOLI | P18196 | 5 | 162 | 0.005 | 0.005 | 885 | 2e-05 | 0.15 |
SSRP_ECOLI | P0A832 | 2 | 514 | 3e-10 | 5.4 | 514 | 5e-31 | 0.35 |
RP5M_RHIME | P17265 | 4 | 15 | 0.005 | 0.12 | 25 | 8e-15 | 0.025 |
KAD_BACSU | P16304 | 5 | 669 | 0.004 | 0.005 | 708 | 0.005 | 0.006 |
Общая тенденция для изменения E-value такова: лучшие результаты "поднимают" значения E-value выше порога, и как побочный эффект E-value ниже порога опускается. Особенно это заметно для второй и третьей последовательностей, для которых количество находок мало и при малом изменении (или отсутствии изменения) количества находок выше порога их худшее E-value уменьшается очень сильно.
Для последовательностей, при поиске по которым выдается много находок, изменение лучших и особенно худших E-value зачастую незаметно.
При установке порога для MINC_ECOLI в 0.001 список стабилизируется на второй итерации с 264 результатами и худшим E-value над порогов 1e-10. Именно это e-value и можно выбрать в качестве порога для того, чтобы результаты не изменились (впрочем, скорее всего список стабилизируется на первой же итерации)