Доменная структура белка METJ_ECOLI
База данных PFAM включает 7426 записей с краткой характеристикой разных семейств белковых доменов, включая их множественные выравнивания. Каждый домен в PFAM описан с помощью HMM-профилей.
Согласно базе данных PFAM в белке METJ_ECOLI существует 1 домен.
Изображение доменной структуры METJ_Ecoli.
Название домена:MetJ
Расположение домена в последовательности: 1-104
Идентификатор записи в PFAM: PF01340
Свойства домена: белок составляют два одинаковых домена (a и b цепи), соединённые с лигандом (SAM) и участком ДНК. Белок выполняет свою функцию встраивая двунитевые антипаралельные b-листы между нитями B формы ДНК, которые связываются с ней водородными связями. Присоединяясь к специфическому участку последовательности нуклеотидов, метиониновый репрессор подавляет экспрессию метионинового регулона и белков участвующих в синтезе SAM (т.е. он саморегулируется).
Наложение доменной структуры на пространственную структуру белка.
red - домен MetJ, цепь A;
сyan - домен MetJ, цепь B;
orange - ДНК (две цепи).