Метаболические пути. KEGG

 

    Поиск графических формул и идентификаторов заданных низкомолекулярных веществ в KEGG.

                                                                                                            Биосинтез          цистеина              из            пирувата.

                                                                                                                                                    

                                                                                                                                       L Cysteine                                 Pyruvate

    Поиск метаболического пути. Выделение цветом пути превращения заданных веществ.

      Метаболический путь был представлен по файлу запроса.

      Файл запроса.

 

Биосинтез цистеина из пирувата.

 

    Исследование выбранного метаболического пути.

 

 Описание выбранного пути.

 Общее число этапов: Один этап.

 Путь превращения пирувата в цистеин.

Этап

Ферментативная реакция

Фермент

1

L-Cysteine + H2O <=> Hydrogen sulfide + Pyruvate + NH3

4.4.1.1

4.4.1.8

Цепочка реакции получилась. Метаболический путь состоит из одной реакции, нетривиальный случай для биохимических метаболических путей.

 

Описание возможности цепочки реакции у различных организмов.

Организм

Возможен ли биосинтез цистеина из пирувата по данным KEGG?

Краткое обоснование

Homo sapiens

Да

 Присутствует необходимый фермент с EC 4.4.1.1

Escherichia coli

Да

 Присутствует необходимый фермент с EC 4.4.1.8

Pseudomonas aeruginosa PAO1

Да

 Присутствует необходимый фермент с EC 4.4.1.1

Methanococcus janaschii

Нет

 По данным KEGG, необходимого фермента с EC 4.4.1.1 или с EC 4.4.1.8 у данного организма не обнаружено.

 

На главную страницу четвёртого семестра

©Дмитрий