Классификация функций. Коды ферментов.
EC 4 Лиазы
Лиазы - это ферменты, разрывающие C-C, C-O, C-N и другие связи другими способами, чем гидролизом или окислением. Они отличаются от других ферментов тем, что у них два субстрата участвуют в одном направлении реакции. а единственный субстрат участвует в реакции с противоположным направлением. Действуя на единственный субстрат, фермент образует двойную связь или новый цикл. Систематическое название формируется согласно принципу "группа субстрата - лиаза". Существуют также тривиальные названия, например, декарбоксилаза, альдолаза и др. Название "дегидратаза" используется для ферментов, устраняющих воду. В случаях, когда обратная реакция более важна, чем прямая реакция, или показано, что она единственная, может бать использовано название "синтаза".
EC 4.1 Лиазы C-C связи
Этот подкласс содержит декарбоксилазы (EC 4.1.1), альдегид-лиазы, катализирующие обращение альдольной конденсации (EC 4.1.2), и оксо-кислотныей лиазы, катализирующие диссоциацию 3-гидроксикислот (EC 4.1.3), или обратные реакции.
EC 4.1.1 Декарбоксилазы
EC 4.1.1.50 Аденозилметионин декарбоксилаза
Название: аденозилметионин декрбоксилаза
Реакция: S-аденозил-L-метионин = (5-деокси-5-аденозил)(3-аминопропил)метилсульфониевая соль + CO2
Другие названия: S-аденозилмитионин декарбоксилаза; S-аденозил-L-метионин декарбоксилаза; S-аденозил-L-метионин карбокси - лиаза
Названия по номенклатуре: S-аденозил-L-метионин карбокси - лиаза [(5-деокси-5-аденозил)(3-аминопропил)метилсульфониевую - соль - образующий]
Комментарии: Белок Escherichia coli содержит пирувиольную группу.
Сравнение доменной структуры ферментов из далеких организмов.
По запросу "([swissprot-ECNumber:4.1.1.50*] & (([swissprot-ID:*HUMAN*] | [swissprot-ID:*ECOLI*]) | [swissprot-ID:*METJA*]))" были найдены 3 белка с EC кодом 4.1.1.50из организмов человека, кишечной палочки Escherichia coli K-12 и археи Methanococcus jannaschii.
|
UniProt ID |
UniProt AC |
Имя гена |
Первый домен |
|
Идентификатор Pfam |
Положение в последовательности |
||||
1 |
DCAM_HUMAN |
P17707 |
AMD1 |
PF01536 |
2 – 329 |
2 |
SPED_ECOLI |
P0A7F6 |
SPED |
PF02675 |
7 – 113 |
3 |
SPEH_METJA |
Q57763 |
SPEH |
PF02675 |
7 – 113 |
Домены белков эволюционно далёких организмов, выполняющие одинаковые функции, не очень сильно схожи по аминокислотным последовательностям.
На главную страницу четвёртого семестра