Назад

Анализ выравнивания. Поиск диагностических позиций

Изображение полученного выравнивания

Различными цветами выделены последовательности, относящиеся к различным таксонам:

  • розовым выделены Alphaproteobacteria;
  • желтым - Gammaproteobacteria;
  • зеленым - Betaproteobacteria;

    Найдем диагностические позиции для таксонов



    Интересно, что внутри таксона Gammaproteobacteria есть еще одно разделение: Q6DB61(RPOZ_ERWCT), P0A800(RPOZ_ECOLI) и P0A803(RPOZ_SALTY) относятся к Enterobacteriales,
    а Q9HTM1(RPOZ_PSEAE) - к Pseudomonadales. И из-за этого в позициях 7, 9, 10, 11-14, 18, 21, 22, 24, 25, 31, 36, 38, 40, 41, 49, 55, 59-63, 71-73, 75, 76, 78, 79, 81, 83-106
    также наблюдается различие в аминокислотных остатках, но чаще всего это замена остатков с одинаковыми свойствами( V->L).



    © Ксения Лежнина 2008