TreeTop

Получили филогенетическое дерево, воспользовавшись сервисом TreeTop
Для этого в поле Alignment ввели выравненные с помощью muscle последовательности белков.
В качестве результата TreeTop предоставляет следующие данные:
заданные пользователем параметры

выравнивание последовательностей
алгоритмы построения - кластерный и топологический
матрицу расстояний(меньшее количество значащих цифр)

Distance Matrix

                1     2     3     4     5     6     7     8     
 1 RPOZ_AGRRK  0.000 0.470 0.837 0.839 0.839 0.827 0.942 0.912
 2 RPOZ_RHOS4  0.470 0.000 0.768 0.765 0.765 0.766 0.865 0.844
 3 RPOZ_ERWCT  0.837 0.768 0.000 0.103 0.103 0.540 0.698 0.748
 4 RPOZ_ECOLI  0.839 0.765 0.103 0.000 0.063 0.545 0.701 0.746
 5 RPOZ_SALTY  0.839 0.765 0.103 0.063 0.000 0.545 0.701 0.746
 6 RPOZ_PSEAE  0.827 0.766 0.540 0.545 0.545 0.000 0.702 0.663
 7 RPOZ_NEIMA  0.942 0.865 0.698 0.701 0.701 0.702 0.000 0.427
 8 RPOZ_RALPJ  0.912 0.844 0.748 0.746 0.746 0.663 0.427 0.000

Graphical Phylogenetic Tree

Тип представления изображения можно менять, пользуясь панелью справа

Результат, выданный TreeTop, полностью соответствует правильному филогенетическому дереву в отличие от результатов, полученных ранее с помощью других программ.
Очевидным преимуществом TreeTop также является яркое графическое изображение.