Торсионные углы

Главная
Назад

Карты Рамачандрана показывают разрешенные и запрещенные конформации для отдельных остатков белка.


Карта Рамачандрана для альфа-спирали
Как того и следовало ожидать, все допустимые значения торсионных углов находятся в 3 квадранте, что характерно для альфа-спирали. Наиболее типичные углы phi:[-63;-59,8] и psi:[-44,7;-40,1].
 
Карта Рамачандрана для белка Psts
Как видно из представленной диаграммы, в белке есть аминокислотные остатки, чьи торсионные углы не входят в область типичных. В основном это остатки глицина. Как известно, его радикал представлен водородом, а значит его торсионные углы могут находиться в более широком диапазоне. Также, исследуя диаграмму, можно сказать, что белок состоит как из альфа-спиралей, так и из бета-тяжей, что соответствует характерному распределению торсионных углов во 2 и 3 квадранте.


© Ксения Лежнина 2008