Учебный сайт Якушева Александра


Практикум 6. Сигналы и мотивы

Задание 2

Данное задание было отправлено на личную почту, поэому здесь не приводится

Задание 4

Для выполнения этого задания был взят геном Swine enteric coronavirus.Из генома были получены фрагменты 100-нуклеотидных upstream последовательностей генов. Они были загружены в веб-версию MEME. Выдача программы приведена ниже:

MEME
Рисунок 1. CS мотив у короновируса, найденный MEME.

Выдача программы MEME в формате html.

Обнаружено 3 сигнала, самый высокий E-value имеет первый из них. Полученный сигнал похож на предсказаный теоретически, так что несмотря на относительно высокий E-value мы принимаем эту выдачу как достоверную.