Описание структуры макромолекулы 3S5R

Структура в целом

Рисунок 1. Структура 3S5R

Данная структура - ДНК-связывающий белок (регулятор транскрипции). Он состоит из двух идентичных полимерных цепей (A, B), обе они входят в биологическую единицу.

Отдельные цепи

Так как в белке цепи индентичны, то данная информация относится к обеим.

Данная макромолекула относится к Syntrophus aciditrophicus SB;

Uniprot_id цепи - Q2LS68; название - Q2LS68_SYNAS, функция - связывание ДНК; мутации в последовательности относительно референса из Uniprot есть.

В составе цепи есть модифицированные аминокислотные остатки, соответствующие строки представлены в файле

Рисунок 2. Во вторичной структуре преобладают спирали

Малые молекулы

  1. PEG

    Name: DI(HYDROXYETHYL)ETHER

  2. Рисунок 3. Белковое окружение для PEG
  3. EDO

    Name: 1,2-ETHANEDIOL

Взаимодействия между аминокислотными остатками

Рисунок 4. Водородные связи, затрагивающие атомы остова белка
Рисунок 5. Водородные связи, затрагивающие атомы боковых радикалов аминокислот
Рисунок 6. Солевой мостик
Рисунок 7. Дисульфидных связей нет, так как все цистеиновые остатки расположены далеко друг от друга
Рисунок 8. T-стекинг