Практикум 4

Структура в целом

Макромолекула FeSOD из археона Thermosynechococcus vestitus с pdb_id=1MY6 состоит всего из 1 биологической субъединицы, которая, в свою очередь, совпадает с ассиметрической. Ассиметрическая единица состоит из 1 уникальной полимерной цепи, которая включает в себя 2 фрагмента (A, B).

Одна биологическая единица, совпадающая с ассиметрической, состоящая из двух идентичных цепей (голубая и зелёная)

Вторичная структура

Вторичная стуктура макромолекулы FeSOD выглядит следующим образом (см. изображение ниже)

Вторичная структура изучаемой макромолекулы. Голубым покрашены альфа-спирали, Красным покрашены бета-складчатые слои

Как видно на изображении выше, в данной макромолекуле значительно преобладают бута-складчатые слои.

Малые молекулы

В записи помимо воды присутствуют Ионы Fe III. Они являются лигандами данного белка.

Белковое окружение ионов Fe III в радиусе 5 ангстрем