Практикум 5

Структура в целом

Макромолекула FeSOD из археона Thermosynechococcus vestitus с pdb_id=1MY6 состоит всего из 1 биологической субъединицы, которая, в свою очередь, совпадает с ассиметрической. Ассиметрическая единица состоит из 1 уникальной полимерной цепи, которая включает в себя 2 фрагмента (A, B).

Взаимодействия в цепи

На следующих изображениях предствлены водородные связи в данной макромолекуле Сами связи обозначены жёлтой пунктирной линией, число на линии обозначает длину связи в ангстремах (Å)

Также были обнаружены солевые мостики Мостики помечены жёлтой пунктирной линией, число на ней означает расстояние между аминокислотами ангстремах (Å)

При помощи скрипта было проверено, что в данной последовательности отсутствует Цистеин (C), по этой причине дисульфидные мостики отсутствуют

В данном белке имеет место стекинг ароматических колец двух Гистидинов (H), показанный на изображении ниже