Главная
I Семестр
II Семестр
Проекты
Обратная Связь
|
Состав записи 1KSK банка PDB
HEADER LYASE
TITLE STRUCTURE OF RSUA
HEADER содержит название белка по некой классификации, дату определения структуры, PDB код структуры.
TITLE содержит имя молекулы белка
Заголовок структуры: Лиаза
Название структуры: Структура RSUA
COMPND MOL_ID: 1;
COMPND 2 MOLECULE: RIBOSOMAL SMALL SUBUNIT PSEUDOURIDINE SYNTHASE A
COMPND 3 CHAIN: A;
COMPND 4 SYNONYM: 16S PSEUDOURIDYLATE 516 SYNTHASE, 16S
COMPND 5 PSEUDOURIDINE 516 SYNTHASE, URACIL HYDROLYASE;
COMPND 6 EC: 4.2.1.70;
COMPND 7 ENGINEERED: YES
Здесь описывается какие цепи какого белка содержатся в файле, номера остатков белков,
синоним названия белка, а также написано что данный белок был получен в результате генно - инженерных опытов.
В поле SEQRES показывается последовательность белка разбитая по цепям. В белке содержится 4 аминокислоты
стоящие под номером "1" так как ученые в ходе рентгенно - структурного анализа не смогли определить, какая из данных
аминокислот стоит раньше .
В строках HET перечислены лиганды, имеющиеся в структуре.
В поле HETNAM расшифровано трехбуквенное название лигандов.
В поле FORMUL – бруттоформула лигандов.
|
Краткое описание одной из цепей белка
Изображение остовной модели одной из цепей (А)
|
 
Изображение одной полипептидной цепи белка в остовной модели.
|
Изображение вторичной структуры (А)
|
 
Тип белка:"альфа+бета"
Красным отмечены альфа-спирали: 8 шт.
Желтым - бета-тяжи: 18 шт.
Синим - бета-повороты: 26 шт.
|
Компоненты структуры, описанной в документе PDB 1KSK
Заголовок структуры: LYASE
Название структуры: STRUCTURE OF RSUA
В документе представлены следующие цепи макромолекул:
Идентификатор цепи | Число остатков | Название молекулы | Комментарии |
A | 233 | RIBOSOMAL SMALL SUBUNIT PSEUDOURIDINE SYNTHASE A | Малая субъединица рибосомальной псеудоуридин синтетазы А |
В документе представлены следующие низкомолекулярные вещества:
ID | Название | Формула лиганда | Число копий | Комментарии |
MSE | SELENOMETHIONINE | C5 H11 N O2 Sе | 4 |
Метионин, в котором сера замещена на селен |
URA | URACIL | C4 H4 N2 O2 | 1 |
Урацил — пиримидиновое основание, которое является компонентом рибонуклеиновых кислот (РНК) |
HOH | Water | H2O | 222 |
Молекулы воды |
|
|