Изображение, которое отображает структуру водородных связей выбранного мной альфа–спирали с остальной частью белка.

Изображены атомы азота (синие) и кислорода (красные) альфа-спирали и остальной части белка, находящиеся не дальше 3.7Å(критерий оброзования водородных связей) друг от друга. Атомы, не принадлежащие альфа-спирали - азота (фиолетовые) и кислорода (оранжевые).

Изображение, которое отображает структуру гидрофобных контактов выбранного мною альфа–спирали с остальной частью белка.

Гидрофобные взаимодеиствия возникают между соответствующими остатками: Ala, Leu, Val, Ile, Pro, Phe, Met и Trp.

Изображны атомы углерода и серы боковых остатков (альфа-спирали и остальной части белка), находящиеся не дальше 5.0Å (критерий наличия гидрофобных взаимодействий) друг от друга. В выбранной альфа спирали нет атомоыв серы, а атомы серы остальной части белка не попали в радиус 5.0Å от атомов углерода альфа-спирали, потэтому изображены только атомы углерода. Атомы углерода, принадлежащие альфа-спирали, подкрашены серым. Атомы углерода, не принадлежащие альфа-спирали, подкрашены сине-зеленым.