Полное имя | Homo sapiens rhodopsin |
Краткое имя | RHO |
Цепь | Прямая |
Хромосома | 5 |
Плечо и полоса | ch3:q22.1 |
Координаты | hg38 chr3:129528640-129535169 |
Альтернативные продукты | один продукт - 5 экзонов, длина 348 аа |
Картинка окрестности гена из Genome Browser c треками гены GENCODE и RefSeq, Conservation, Common SNPs.
Для выравнивания гена родопсина человека и шимпанзе программа distmat выдает 0,74 замены на 100 нуклеотидов.
Если частоту встречаемости SNP в популяции человека выставить от 0,025 до 0,5 (интервал выбран случайно),
то в популяции будет 0,27 замен на 100 нуклеотидов.
Ниже 0,025 просто наблюдается очень большой скачок числа SNP.
Само выравнивание: HC.fasta
© Наумова Юлия, 2018