Три блока: (i) Вертикальный плюс-блок (ii) Частичный плюс-блок (iii) Минус-блок

Был выбран домен соответствующий Acylglycerol kinase C-terminal. В выравнивании отмечены Вертикальный плюс-блок, Частичный плюс-блок и Минус-блок. Частичный плюс-блок состоит 15 последовательностей белков. Покраска по Clustalx. Пояснение: в квадратные скобки брались аминокислоты, принадлежащие к одной функциональной группе (алифатические, ароматические, гидрофильные, гидрофобные, незаряженные, заряженные (отрицательно)). Так же составлены патерны для их поиска.

NameIDACSeedFull
Acylglycerol kinase C-terminalAGK_CPF1971220493

Файл с выравниванием в Jalview:Alignment-11.jvp.
V-Вертикальный плюс-блок;P-Частичный плюс-блок;M-Минус-блок.

БлокКоординатыПаттерн
Вертикальный плюс-блок1-36[VLM]..[IL].[W][G]..[R][D].{7}[Y][WL][Y][L][G][P][LM][K]..[A].[HY][WFL][FL]..[LF]
Частичный плюс-блок141-147[W].{5}[S].[ILVA][E][L].[IV].{3}[N]
Минус-блок163-167Отсутствует