PyMol

 

Проведение мутации

Средствами Tcl/Tk интерфейса (Wizard->Mutagenesis) проведена мутация в белке, которая должна привести к потере связывания с лигандом.

Было найдено взаимодействие лиганда с аминокислотным остатком белка (ASN103)

Была произведена замена ASN103 на MET103, вследствии чего, связь между азотом остатка ASN103 была нарушена.

 

 

Создание ролика

Скрипт для просмотра ролика (mov.pml)

Необходимые файлы(1LMP.pdb и 1LMP_mut.pdb)

Валентинка

Создана полиаланиновая последовательность в форме валентинки

 

Создан скрипт для построения поли-аланиновой-альфа спирали длинной 100 аминкислот.

 

 

© Замараев Алексей