Белки PURK_ECOLI и FADH_BACSU совершенно разные по функциям: синтаза модифицированных рибонуклеотидов (лигаза) и 2,4-диеноил редуктаза (оксидоредуктаза); и относятся к разным видам бактерий, но удивительно, что их выравнивания оказались сопоставимыми, например, с выравниваниями DACB_ECOLI и DACB_BACSU, которые казались мне в предыдущем задании гомологами. Выравнивание белков DACB_ECOLI и DACB_BACSU. Возможно, дело в том, что в DACB_BACSU произошла большая делеция, которая сильно испортила показатели выравнивания, хотя в целом видно, что у белков DACB гомологичная область больше, чем у PURK_ECOLI и FADH_BACSU. Выравнивание белков PURK_ECOLI и FADH_BACSU. Хотя, конечно, нечто подобное есть и во втором вырвнивании.

Возможно, стоит обратить внимание на то, что у глобальных выравниваний обоих пар Score почти одинаковый (26,5 и 28,5), а при переходе к локальному выравниванию, у пары DACB он возрастает гораздо сильнее (53,0 против 34,5). Показатели % Identity и % Similarity у пары DACB и PURK_ECOLI и FADH_BACSU очень похожи в локальном выравнивании (23.7% и 35.6% против 21,5% и 38,0%), но это нормально, потому что процент покрытия у DACB гораздо больше (38.8% и 51.3% против 17,5% и 28,7%).