Задание 1.
a)
Краткое имя гена - RHO, полное имя гена - Homo sapiens rhodopsin, + цепь, 3 хромосома, плечо и полоса - ch3:q22.1, координаты - hg38 chr3:129528640-129535169, альтернативный продукт - один, 5 экзонов, длина - 348 аа.
b)
Рисунок 1. Картинка окрестности гена из Genome Browser c треками гены GENCODE и RefSeq, Conservation, Common SNPs.
Задание 2.
Для выравнивания гена родопсина человека и шимпанзе программа distmat выдает 0,74 замены на 100 нуклеотидов. Если выставить в Variation table частоту встречаемости SNP в популяции человека от 0,025 до 0,5, то в популяции людей окжется 0,27 замен на 100 нуклеотидов. Это не так уж мало. Хотя сравнивать это число с числом 0,74 вряд ли имеет смысл, потому что интервал 0,025-0,5 был выбран практически случайно. То есть ниже 0,025 просто наблюдается очень большой скачок числа SNP.