Проблемные нуклеотиды:
Рисунок 1. В 67 позиции прямого прочтения и в 112 - обратного - почти одинаковые по высоте пики А и С. Такое совпадение маловероятно, так что я считаю, что это - полиморфизм. Заменила N на w.
Рисунок 2. В 226 позиции прямого прочтения пики Т и С сравнимы по высоте, так что, возможно, это - полиморфизм. А в обратном прочтении 271 пик Т, похоже, слился с 272 пиком Т и получилось N.
Рисунок 3. В 252 позиции обратного прочтения пятно зеленой краски, похоже, замаскировало пик С, который в 207 позиции прямого прочтения, кстати, есть. Заменила N на с.
Характеристика хроматограммы в целом:
Длины нечитаемых участков:
прямое прочтение | обратное прочтение | |
начальный участок | 21 | 9 |
конечный участок | 6 | 89 |
Сигнал и шум на глаз в среднем соотносятся как 7:1.
Сила шума очень равномерна на протяжении всей последовательности. Сила сигнала неравномерна.
В целом хроматограмма хорошая, шум относительно слабый.
Рисунок 4. В данной хроматограмме шум вообще не отличим от сигнала, а также есть пятно красок в районе 390-395 нуклеотидов. Образец был загрязнен либо другими ДНК, либо чем-то еще хуже.
© Belousova Evgenia, 2018