Практикум 1. Филогенетические деревья.


Таблица 1. Отобранные бактерии.

НазваниеМнемоникаТаксон
Bordetella pertussisBORPE cellular organisms; Bacteria; Proteobacteria; Betaproteobacteria; Burkholderiales; Alcaligenaceae; Bordetella
Burkholderia cenocepaciaBURCA cellular organisms; Bacteria; Proteobacteria; Betaproteobacteria; Burkholderiales; Burkholderiaceae; Burkholderia
Neisseria meningitidisNEIMA cellular organisms; Bacteria; Proteobacteria; Betaproteobacteria; Neisseriales; Neisseriaceae; Neisseria
Rhizobium melilotiRHIME cellular organisms; Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhizobiales; Rhizobiaceae; Sinorhizobium/Ensifer group; Sinorhizobium
Thiobacillus denitrificansTHIDA cellular organisms; Bacteria; Proteobacteria; Betaproteobacteria; Nitrosomonadales; Thiobacillaceae; Thiobacillus
Yersinia pestisYERPE cellular organisms; Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacterales; Yersiniaceae; Yersinia
Pasteurella multocidaPASMU cellular organisms; Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Pasteurellales; Pasteurellaceae; Pasteurella


Скобочная формула дерева:

(((YERPE, PASMU), (NEIMA, (THIDA, (BORPE, BURCA)))), RHIME);



Рис. 1. Изображение дерева.



Ветви дерева:

Дерево содержит 4 нетривиальных ветвей:
{YERPE, PASMU} против {NEIMA, THIDA, BORPE, BURCA, RHIME}, отделяет таксон Gammaproteobacteria
{YERPE, PASMU, NEIMA, THIDA, RHIME} против {BORPE, BURCA}, отделяет таксон Burkholderiales
{YERPE, PASMU, NEIMA, RHIME} против {THIDA, BORPE, BURCA}
{YERPE, PASMU, RHIME} против {NEIMA, THIDA, BORPE, BURCA}, отделяет таксон Betaproteobacteria






© Belousova Evgenia, 2018