Задание 4.
Таблица 1. Отобранные бактерии.
| Название | Мнемоника | Таксон |
| Bordetella pertussis | BORPE | b-proteobacteria |
| Burkholderia cenocepacia | BURCA | b-proteobacteria |
| Neisseria meningitidis | NEIMA | b-proteobacteria |
| Rhizobium meliloti | RHIME | a-proteobacteria |
| Thiobacillus denitrificans | THIDA | b-proteobacteria |
| Yersinia pestis | YERPE | enterobacteria |
| Pasteurella multocida | PASMU | g-proteobacteria |
Изображение дерева бактерий, полученного в MEGA.
Изображение дерева гомологов СLPX: сами белки СLPX, белки HSLU и RUVB. Дерево получено в MEGA методом UPGMA.
Группы попарно ортологичных белков - в зеленых рамках, примеры пар паралогов: CLPX_RHIME и HSLU_RHIME, CLPX_PASMU и HSLU_PASMU, CLPX_RHIME и RUVB_RHIME. Во всех этих парах паралогов дупликация произошла давно, еще до разделения видов. События дупликаций показаны оранжевыми стрелками, разделения путей эволюции белков в результате видообразования - голубыми стрелками.