Краткое описание генома вируса (Ageratum latent virus)


Данный вирус относят к одному из видов вируса табачной мозайки. Вирус Ageratum latent virus (AgLV) поражает Ageratum houstonianum (Агератум Гаустона). [1]

AgLV широко распространен в восточной Австралии. Вирус относится к подгруппе 1 ilavirus Tobacco streak virus (TSV). Генетически различные штаммы TSV и AgLV обычно проявляются бессимптомно у других видов растений,произрастающих в восточной части Австралии. [2]

Далее в таблице 1 представлены некоторые количественные и качественные данные о вирусе.

Таблица 1.
Параметр Значение
Английское (или латинское) название вируса Ageratum latent virus
Русское название вируса Латентный вирус Агератум
Количество фрагментов в полном геноме 3
Общая длина генома (п.н.) 8523
Количество кодируемых в геноме полипептидов 5
Количество "зрелых" вирусных белков 5

Аминокислотная последовательность

>YP_008470973.1 coat protein
MNTLNKSPDLPSNAMSTSRSFNNRNCQVCFDELDALANNCPRHGKVNQPSNRQRRNARRA
ANYRNQTAMVRPVPVVPVSRPKTTASLKLPGNQVWVTRKASEWAAKTVDTNDAIPLKTIM
DGIPEITEESKIYRLLIGFVAVSTGTFGIVDGVTGDVIPDPPVVGRLGFQKNTYRCRDIN
LEGKTPSQLDGKAIVWCLDSNKRDAKRVMLANYWLAISKPAPLMPPEDFLVESSD

Источники:
[1] Virus-Host DB,2016
[2] Genetic diversity of subgroup 1 ilarviruses from Eastern Australia.Sharman M., Thomas JE. 2013

На главную