Таблица 1. Параметры водородных связей между остовными
атомами во вторичной структуре |
| # |
Имена атомов |
Длина связи (Å) |
Угол N-O-C (°) |
| Альфа-спирали |
| 1 |
N(376TYR)-O(372ILE) |
3.07 |
147.8 |
| 2 |
N(378ARG)-O(374ALA) |
2.83 |
157.4 |
| 3 |
N(384ALA)-O(380ALA) |
2.84 |
156.0 |
| Бета-тяжи |
| 1 |
N(73GLY)-O(94TYR) |
2.74 |
143.8 |
| 2 |
N(75VAL)-O(92ARG) |
2.88 |
163.1 |
| 3 |
N(91GLY)-O(75VAL) |
2.81 |
131.5 |
Выводы:
Полученные данны позволяют сделать некоторые выводы. Так, можно заметить, что
длина водородных связей приблизительно равна 3 ангстремам. Длина между атомами в бета-тяжах
колеблется меньше, что указывает на более устойчивые связи.
Углы же имеют куда больший разброс по значениям. В среднем они колеблются от 130 до 160
градусов. В бета-тяжах данный показатель несколько выше, чем в альфа-спиралях.