Практикум 9.KEGG
Общие сведения о метаболическом пути: Complement and coagulation cascades (Комплементарный и коагуляционный каскады)
Биосинтез аргинина осуществляется из цитруллина под действием аргининсукцинатсинтазы и аргининсукцинатлиазы.
Аргинин синтезируется в организме человека в процессе обезвреживания аммиака.
Одним из путей связывания аммиака является синтез мочевины, к
оторый происходит в печени, единственном органе, который содержит аргиназу – фермент, расщепляющий аргинин.
Процесс синтеза мочевины, побочным продуктом которого является аргинин, известен как орнитиновый цикл Кребса – Гензелейта. Реакции орнитинового цикла происходят в митохондриях и цитоплазме клеток печени.
В митохондриях печени аммиак соединяется с углекислым газом и водой под воздействием фермента карбамоилфосфатсинтетазы в присутствии ионов Магния и используя энергию двух молекул АТФ.
Образуется вещество карбамоилфосфат.
Затем аминогруппа с карбамоилфосфата
переносится на аминокислоту орнитин,
в результате чего получается аминокислота цитруллин.
Цитруллин
выходит из митохондрий в цитоплазму клеток печени, г
де происходят дальнейшие превращения: он соединяется с аспартатом (
аспарагиновой кислотой) образуя аргининосукцинат, иначе говоря, аргининоянтарную кислоту.
Наконец, аргининосукцинат расщепляется на фумарат и аргинин.
Вот и образовался аргинин. Но в печени под воздействием
фермента аргиназы в присутствии ионов Кальция и Магния аргинин
распадается с образованием мочевины и аминокислоты орнитина.
Орнитин вновь вступает в реакцию с
карбамоилфосфатом, и цикл крутится дальше.
Аммиак поставляется в печень с кровью по воротной вене,
но может образовываться в митохондриях при отщеплении аминной головы глутаминовой кислоты,
которая является основным переносчиком аминных групп по организму.
Аргинин является одним из ключевых метаболитов в процессах азотистого обмена
ID: map00220
Ссылка на KEGG
Рис.1 Общая схема
биосинтеза аргинина. Красным обозначана реакция с участием НАДНФ
Пунктирными линиями обозначены реакции связанные с другими метоболическими путями.
Биосинтез аргинина связан с 6 путями. Синими кружочками обозначены вещества,
которые обеспечивают связь с другими метаболическими путями.
Связанные метаболические пути:
Nitrogen metabolism
Cytrate circle
Purimidine metabolism
Arginine and proline metabolism
D-arginine D-Orn metabolism
Alanine,aspartate and glutamate metabolism
Метаболический путь синтеза аргинина(00220) в разных доменах жизни
Эукариот: Chlorocebus sabaeus (green monkey)-(тип-Хордовый, класс-Млекопитающие)
Бактерия: Escherichia coli DH1 ( Тип-Протеобактерии, Класс-Гамма-протеобактерии
Архея: Candidatus Nitrosotenuis cloacae(тип- Thaumarchaeota)
Рис.2 Chlorocebus sabaeus (green monkey)
Рис.3 Escherichia coli DH1
Рис.4 Candidatus Nitrosotenuis cloacae
Данные пути частично или полностью присутсвуют в различных организмах.
Реакция дефосфолирирования Лизина-L-глутамил-5-фосфата в базе данных KEGG
ID:R10931
LysW-L-glutamyl 5-phosphate + NADPH + H+ <=> LysW-L-glutamate 5-semialdehyde + NADP+ + Orthophosphate
Ссылка на реакцию
На Рис.1 красным обозначена данная реакция
Рис.5 Реакция дефосфолирирования Лизин-L-глутамил-5-фосфата
Ссылка на источник:
Cинтез аргинина
Википедия