Практикум 9.KEGG

Общие сведения о метаболическом пути: Complement and coagulation cascades (Комплементарный и коагуляционный каскады)

Биосинтез аргинина осуществляется из цитруллина под действием аргининсукцинатсинтазы и аргининсукцинатлиазы. Аргинин синтезируется в организме человека в процессе обезвреживания аммиака. Одним из путей связывания аммиака является синтез мочевины, к оторый происходит в печени, единственном органе, который содержит аргиназу – фермент, расщепляющий аргинин. Процесс синтеза мочевины, побочным продуктом которого является аргинин, известен как орнитиновый цикл Кребса – Гензелейта. Реакции орнитинового цикла происходят в митохондриях и цитоплазме клеток печени. В митохондриях печени аммиак соединяется с углекислым газом и водой под воздействием фермента карбамоилфосфатсинтетазы в присутствии ионов Магния и используя энергию двух молекул АТФ. Образуется вещество карбамоилфосфат. Затем аминогруппа с карбамоилфосфата переносится на аминокислоту орнитин, в результате чего получается аминокислота цитруллин. Цитруллин выходит из митохондрий в цитоплазму клеток печени, г де происходят дальнейшие превращения: он соединяется с аспартатом ( аспарагиновой кислотой) образуя аргининосукцинат, иначе говоря, аргининоянтарную кислоту. Наконец, аргининосукцинат расщепляется на фумарат и аргинин. Вот и образовался аргинин. Но в печени под воздействием фермента аргиназы в присутствии ионов Кальция и Магния аргинин распадается с образованием мочевины и аминокислоты орнитина. Орнитин вновь вступает в реакцию с карбамоилфосфатом, и цикл крутится дальше. Аммиак поставляется в печень с кровью по воротной вене, но может образовываться в митохондриях при отщеплении аминной головы глутаминовой кислоты, которая является основным переносчиком аминных групп по организму. Аргинин является одним из ключевых метаболитов в процессах азотистого обмена
ID: map00220
Ссылка на KEGG

Рис.1 Общая схема биосинтеза аргинина. Красным обозначана реакция с участием НАДНФ
Пунктирными линиями обозначены реакции связанные с другими метоболическими путями. Биосинтез аргинина связан с 6 путями. Синими кружочками обозначены вещества, которые обеспечивают связь с другими метаболическими путями.
Связанные метаболические пути:
Nitrogen metabolism
Cytrate circle
Purimidine metabolism
Arginine and proline metabolism
D-arginine D-Orn metabolism
Alanine,aspartate and glutamate metabolism

Метаболический путь синтеза аргинина(00220) в разных доменах жизни


Эукариот: Chlorocebus sabaeus (green monkey)-(тип-Хордовый, класс-Млекопитающие)
Бактерия: Escherichia coli DH1 ( Тип-Протеобактерии, Класс-Гамма-протеобактерии
Архея: Candidatus Nitrosotenuis cloacae(тип- Thaumarchaeota)

Рис.2 Chlorocebus sabaeus (green monkey)

Рис.3 Escherichia coli DH1

Рис.4 Candidatus Nitrosotenuis cloacae
Данные пути частично или полностью присутсвуют в различных организмах.

Реакция дефосфолирирования Лизина-L-глутамил-5-фосфата в базе данных KEGG


ID:R10931
LysW-L-glutamyl 5-phosphate + NADPH + H+ <=> LysW-L-glutamate 5-semialdehyde + NADP+ + Orthophosphate
Ссылка на реакцию
На Рис.1 красным обозначена данная реакция

Рис.5 Реакция дефосфолирирования Лизин-L-глутамил-5-фосфата
Ссылка на источник: Cинтез аргинина
Википедия