Описание цитохрома С-552 из генома бактерии Thioalkalivibrio nitratireducens.
Основная информация о цитохроме С-552
Я проанализировал аминокислотную последовательность данного белка и нуклеотидную последовательность, кодирующую его. Полученные данные приведены в таблице 1.
| Идентификатор белка | AGA31970.1 |
|---|---|
| Идентификатор генома | CP003989 |
| Название белка | Cytochrome C-552 |
| Координаты гена в геноме | 255589..257250 |
| Длина гена (п.н.) | 1659 |
| Цепь | прямая |
| Длина белка (а.о.) | 553 |
Информация получена на сайте NCBI. FastA-файл с аминокислотной последовательностью белка
Принимает участие в метаболизме азота у Thioalkalivibrio nitratireducens, катализируя реакцию восстановления нитрит-ионов до ионов аммония.
Геномное окружение белка
В библиотеке NCBI со страницы белка можно перейти к полному геному. Вкладка Graphics позволяет найти нужный локус по координатам гена и экспортировать изображение его окружения, что я и сделал.
Таким образом, я научился самостоятельно добывать необходимые сведения об объекте изучения.