В данном практикуме была продолжена работа со структурой белкa. Задачей практикума стал поиск в данном белке следующих взаимодействий:

Водородные связи, затрагивающие атомы остова белка

Данный тип водородных связей формируется между атомом водорода в NH-группах и между атомом кислорода в CO-группе аминокислотных остатков главной цепи.

Водородная связь, затрагивающая атомы остова белка
Рисунок 1. Водородная связь, затрагивающая атомы остова белка.

Водородные связи, затрагивающие атомы боковых радикалов аминокислот

Формируются между атомами Н (водорода) и N (азота) или O (кислорода) и N (азота).

Водородная связь, затрагивающая атомы боковых радикалов аминокислот
Рисунок 2. Водородная связь, затрагивающая атомы боковых радикалов аминокислот.

Солевые мостики

Красным цветом выдеены все солевые мостики. Они фирмируютя между радикалами положительно и отрицательно заряженных аминокислот.

Все солевые мостики
Рисунок 3. Все солевые мостики.
salt
Рисунок 4. Солевой мостик.

Стейкинг

T-стекинг
Рисунок 5. T-стекинг.

Дисульфидные связи

Дисульфидных мостиков и цистеинов в исследуемом белке найдено не было.