Фрагмент вторичной структуры

Работа с программой Rasmol


Исследовался фрагмент вторичной структуры c 184-го по 219-ый остатки (изображён слева). Фрагмент образует бета-лист и имеет классический патерн расположения водородных связей. Причём закономерность расположения выполняется достаточно строго.


H ( i -> j )
H ( j -> i )
H ( i + 2 -> j +2 )
H ( j + 2 -> i +2 )




В ориентации СВ-атомов видится следующее правило: каждый последующий СВ-атом в одном бета-тяже направлен в противоположную сторону по сравнению с предыдущим; в двух антипараллельных бета-тяжах, составляющих бета-лист, идущие рядом СВ-атомы направлены в одну и ту же сторону относительно плоскости бета-листа. Закономерность не строгая и может нарушаться, в особенности вблизи точки "разворота" бета-тяжа.





На первый семестр здесь.

Переход на главную страничку здесь.