Фрагмент вторичной структуры
Работа с программой Rasmol
 |
Исследовался фрагмент вторичной структуры c 184-го по 219-ый остатки (изображён слева).
Фрагмент образует бета-лист и имеет классический патерн расположения водородных связей. Причём закономерность
расположения выполняется достаточно строго.
H ( i -> j )
H ( j -> i )
H ( i + 2 -> j +2 )
H ( j + 2 -> i +2 )
|
В ориентации СВ-атомов видится следующее правило: каждый последующий СВ-атом в одном бета-тяже направлен в противоположную сторону по
сравнению с предыдущим; в двух антипараллельных бета-тяжах, составляющих бета-лист, идущие рядом СВ-атомы направлены в одну и ту же
сторону относительно плоскости бета-листа. Закономерность не строгая и может нарушаться, в особенности вблизи точки "разворота" бета-тяжа.
На первый семестр здесь.
Переход на главную страничку здесь.