База данных PFAM включает не менее 7459 записей с краткой характеристикой разных семейств белковых доменов, включая их множественные выравнивания. Каждый домен в PFAM описан с помощью профиля-НМM.

Согласно базе данных PFAM, в белке TolB protein precursor E.coli cуществует 6 доменов.

Изображение доменной структуры TolB protein precursor E.coliI:




N-концевой домен TolB_N и пять повторяющихся доменов PD40.

Краткое описание домена

1. краткое название: TolB_N
2. расположение в последовательности: 35-174
3. функция домена не установлена
4. отчасти структурно схож с С-концевым доменом лигазы транспортной РНК

Краткое описание домена

1. краткое название: PD40
2. расположение в последовательности: домен повторяется
   в цепи 5 раз на участках 193-229, 238-273, 281-317, 325-361, 369-406
3. функция домена также не установлена
4. схож с многочисленными членами семейства пролилолигопептидаз,
   и, в меньшей степени с белками класса В лактамаз,

Наложение доменной структуры на пространственную структуру белка




На картинке изображена простанственная структура всего белка
TolB protein precursor E.coli

Красным цветом обозначен 5 доменов PD40,
зелёным цветом - домен TolB_N, серым - участки белка, не входящие в состав домена.