Pyrobaculum aerophilum - Грам-отрицательный, экстремально термофильный архей, имеющий форму палочки с почти прямоугольными концами и размеры около 3-8 * 0.6 µm. Может жить при температуре от 75 до 104С, при этом оптимальная температура составляет 100С. Образует грязно-желтые колонии круглой формы. Обычен для геотермальных источников и черных курильщиков. Впервые был получен из пробы кипящей морской воды в Maronti Beach, Ischia, в Италии. Поэтому не удивительно, что родовое название Pyrobaculum aerophilum переводится с латыни как "огненная палочка".

В отличие от большинства других термофильных архей, Pyrobaculum aerophilum хорошо растёт в микроаэрофильных условиях, что облегчает работу с ним в лаборатории и делает его удобным объектом для исследования биологии архей и термофильных микроорганизмов.

P. aerophilum факультативный хемоавтотроф, который может использовать кислород, нитрат, нитрит, арсенат, селенат, селенит, цитрат и оксид железа в качестве конечных акцепторов электронов. Максимальная плотность колоний была получена на комплексных органических субстратах, хотя и в отсутствии органических соединений P. aerophilum растёт хемолитоавтотрофно, используя молекулярный водород или тиосульфат.

Рост P. aerophilum ингибируется присутствием атомарной серы, что отличает его от других видов рода Pyrobaculum.

Полный геном Pyrobaculum aerophilum был опубликован в 2002 году и составляет 2.2-mb (mb - megabase, 2 в 20й степени оснований). Содержание G + C - 51%.

На данный момент было найдено 2595 кодирующих белки участков со средней длинной 758 аминокислотных остатков. Они покрывают 89% генома.

У P. aerophilum отсутствует 5' - нетранслируемый регион мРНК, таким образом они не используют сайт посадки рибосом (последовательность Шайна-Дальгарно) для инициации трансляции.

Также, для штамма IM2 P. aerophilum характерна высокая скорость накопления мутаций, что может объясняться отсутствием системы мисмэтч репарации.

Что интересно, в белках P. aerophilum не была найдена аминокислота селеноцистеин.

P. aerophilum является важным модельным объектом для изучения молекулярных основ терморезистентности и потенциальным источником биокатализаторов. Именно поэтому и был секвенирован геном этого замечательного архея.

Источники:

Статьи:

• Transcriptional map of respiratory versatility in the hyperthermophilic crenarchaeon Pyrobaculum aerophilum. Cozen AE, Weirauch MT, Pollard KS, Bernick DL, Stuart JM, Lowe TM.
  PMID: 19047344


• Genome sequence of the hyperthermophilic crenarchaeon Pyrobaculum aerophilum. Fitz-Gibbon ST, Ladner H, Kim UJ, Stetter KO, Simon MI, Miller JH.
  PMID: 11792869
Были найдены в PubMed по запросу "pyrobaculum aerophilum[TI]"


• Karyn's Genomes

Картинки:

• отсюда
• отсюда
• и отсюда