Банк данных Uniprot
 Метка поляСодержание
Код(ы) доступа ("Accession number")ACP40871
Идентификатор записи в БДIDDHBE_BACSU
Название (краткое описание) белкаDE RecName: Full=2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase;
EC=6.3.2.-;
AltName: Full=Dihydroxybenzoic acid-activating enzyme;
Дата создания документаDT 01-FEB-1995, integrated into UniProtKB/Swiss-Prot.
Дата последнего исправления аннотацииDT 11-JAN-2011, entry version 84.
Число публикаций, использованных при создании документаRN 4
Журнал и год самой поздней публикацииRL Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99:12120-12125(2002).
Ключевые словаKW 3D-structure; ATP-binding; Complete proteome; Cytoplasm; Ligase; Nucleotide-binding.
Что содержит поле комментариев?CC FUNCTION: Activation of the carboxylate group of 2,3-dihydroxy-benzoate (DHB), via ATP-dependent PPi exchange reactions, to the acyladenylate.
PATHWAY: Siderophore biosynthesis; bacillibactin biosynthesis.
SUBCELLULAR LOCATION: Cytoplasm (Potential).
SIMILARITY: Belongs to the ATP-dependent AMP-binding enzyme family.
------------------------------------------------------
Copyrighted by the UniProt Consortium, see http://www.uniprot.org/terms
Distributed under the Creative Commons Attribution-NoDerivs License
------------------------------------------------------
Тут у нас: функция, в каком метаболическом пути участвует,
где в клетке находится, к какому семейству белков относится,
между пунктирными линиями про копирайт и лицензию.
Идентификаторы записей PDBDR 1MD9
1MDB
1MDF
Для функционирования DhbE АТФ небходимо,
так как функция DhbE состоит в активиации этой самой АТФ
карбоксильной группы 2,3-дигидроксибензоата.
См. комметнарии(CC), 1 строчка.
Запрос Число записей в SwissProt Число записей в TrEMBL
"2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase"4322
"Dihydroxybenzoic acid-activating enzyme"47
"ec:6.3.2.-"485415513
"ec=6.3.2.-" and "Dihydroxybenzoic acid-activating enzyme"26
 Метка поляБелок 1Белок 2
Первый код доступаACP40871P10378
Идентификатор последовательности в БДIDDHBE_BACSUENTE_ECOLI
Название (краткое описание) белкаDERecName: Full=2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase;
EC=6.3.2.-;
AltName: Full=Dihydroxybenzoic acid-activating enzyme;
RecName: Full=Enterobactin synthase component E;
AltName: Full=Enterochelin synthase E;
Includes:
RecName: Full=2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase;
EC=2.7.7.58;
AltName: Full=Dihydroxybenzoic acid-activating enzyme;
Includes:
RecName: Full=S-dihydroxybenzoyltransferase;
EC=2.3.1.-;
Дата создания документаDT01-FEB-1995,
integrated into UniProtKB/Swiss-Prot.
101-JUL-1989,
integrated into UniProtKB/Swiss-Prot.
Дата последнего исправления аннотацииDT08-FEB-2011,
entry version 85.
108-FEB-2011,
entry version 102.
Название организмаOSBacillus subtilis. Escherichia coli (strain K12)
Классификация организма (список таксонов)OCBacteria; Firmicutes; Bacillales; Bacillaceae; Bacillus. Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Escherichia.
Длина последовательностиSQ, ID тоже 539 AA 536 AA
Молекулярная масса белкаSQ59928 MW (MW - molar weight, видимо, в Да.)59112 MW
Число публикаций, использованных при создании документаRN47
Журнал и год самой поздней публикацииRLProc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99:12120-12125(2002). Mol. Syst. Biol. 2:E1-E5(2006).
Описание вторичной структурыFTвот тутнет
Ключевые словаKW3D-structure; ATP-binding; Complete proteome; Cytoplasm; Ligase; Nucleotide-binding. Acyltransferase; ATP-binding; Complete proteome; Enterobactin biosynthesis; Ligase; Multifunctional enzyme; Nucleotide-binding; Transferase.
Темы, освещённые в комментарияхCCFUNCTION, PATHWAY, SUBCELLULAR LOCATION, SIMILARITY
функция, метаболический путь, внутриклеточная локализация, к какому семейству ферментов принадлежит
FUNCTION: Activates the carboxylate group of 2,3-dihydroxy- benzoate (2,3-DHB), via ATP-dependent PPi exchange reactions, to the acyladenylate. Then, catalyzes the acylation of holo-EntB with 2,3-DHB adenylate, preparing that molecule for amide bond formation with L-serine.
CATALYTIC ACTIVITY: ATP + 2,3-dihydroxybenzoate = diphosphate + (2,3-dihydroxybenzoyl)adenylate.
CATALYTIC ACTIVITY: (2,3-dihydroxybenzoyl)adenylate + holo-entB = adenosine 5'-monophosphate + acyl-holo-entB.
PATHWAY: Siderophore biosynthesis; enterobactin biosynthesis.
SUBUNIT: Proteins EntB, EntD, EntE, and EntF form a multienzyme complex called enterobactin synthase.
SIMILARITY: Belongs to the ATP-dependent AMP-binding enzyme family. EntE subfamily.
------------------------
функция, каталитическая активность, метаболический путь, из каких субъединиц состоит мультиферментный комплекс, к какому семейству ферментов принадлежит
Особенности последовательностиFT CONFLICT 360 360 Y -> I (in Ref. 3; AAA79759)CONFLICT 369 378 DAEGNPLPQG -> ECRRKSTAAR (in Ref. 1; CAA33158).
Идентификаторы записей PDBDR 1MD9
1MDB
1MDF
нет
В отличие от DhbE из B. subtilis EntE из E. coli обладает ещё и трансферазной активностью.
Видимо, авторы описания считают её более важной, так как в DE оба раза он отнесён к трансферазам.
Оба белка входят в состав мультиферментного комплекса энтеробактинсинтазы и обладают одинаковой каталитической активностью: активацией дигидроксибензоата.
Молекулярные массы очень близки.
Несмотря на относительно далёкое родство B. subtilis и E. coli, можно сделать предположение о гомологии DhbE и EntE.
На DhbE из B. subtilis также похож VibE - белок холерного вибриона. Он не обладает дополнительной трансферазной активностью, как EntE, но в отличие от DhbE является трансмембранным белком.

Информация:


© Eugenia Zotova