- Поиск в геноме участков, кодирующих белки, похожие на заданный
Поиск гомологов белка DhbE в геноме L. monocytogenes
Число находок с E-value < 0,001 |
3 |
| E-value лучшей находки | 2e-33 |
| Название последовательности с лучшей находкой | AL591984 |
| Координаты лучшей находки (от-до) | 76459 - 77973 |
| Процент последовательности белка, вошедший в выравнивание с лучшей находкой | 92.2% |
- Нахождение записи EMBL по последовательности программой BLASTN
Данная последовательность присутствует в EM_PRO:AB001608 (Streptomyces virginiae DNA for BarX, complete cds)
Координаты последовательности в записи: 244..1128, причем данная последовательность соответствует найденной.
В поле FT описан участок, включающий данную последовательность: ген barX, кодирующий белок BarX (BAA23611.1), направление последовательности совпадает с направлением записи.
- Поиск гомологов гена программой BLASTN
Лучшая находка - AL591984, имеет e-value - 2.3, координаты находки в последовательности - 163486..163467.
Поиск по нуклеотидной последовательности гораздо менее точный, находки короткие, их меньше и e-value очень большие, и лучшая находка в 2х вариантах поиска не совпала.
Вероятно, данный эффект можно объяснить вырожденностью генетического кода.