Геномные браузеры
  1. EnsEMBL.

BLAST/BLAT

На странице результатов представлена схема расположения найденных последовательностей на хромосомах человека, указано относительное положение последовательности запроса и найденных последовательностей, а также подробная информация по выравниваниям.

На странице "Contig view" можно получить информацию о расположении гена на хромосоме, других расположенных рядом генах, их количестве, типе и т.п

При поиске по имени гена можно кликнуть на ссылку, и посмотреть на результаты в "Contig view", а также в отдельных вкладках получить информацию отдельно по гену и по транскрипту.



  1. Другие геномные браузеры.

UCSC. Первое знакомство с этим браузером вызвало у меня шок. Сложно придумать что-либо более недружественное.

Vega. Отличается от Ensembl только кавайной розово-голубой гаммой...

NCBI. Отказался показывать ген при переходе по ссылке с Ensembl.




© Eugenia Zotova