Классификация ферментов (EC)
  1. Сбор информации о ферменте ECHB_HUMAN

EC: 2.3.1.16

Расшифровка:

2- трансферазы,

2.3 - ацилтрансферазы,

2.3.1 - перенос групп, отличных от аминоацильных,

2.3.1.16 - ацетил-КоА-ацилтрансферазы.

Схема реакции: Ацил-КоA + ацетил-КoA = КoA + 3-оксоацил-КoA.



  1. Степень сохранения функции фермента у белков со сходными последовательностями.

Нашлось 1360 ферментов, из них у 205 совпадает подкласс, у 152 - подподкласс и у 5 - вся классификация.

По результатам выдачи бласта мною были сформированы 2 таблицы (id-идентичность-EC) с разными e-value

итоговая таблица для е-value=10

итоговая таблица для е-value=1

Легенда: зеленый цвет -полное совпадение классификации, желтый - совпадение подподклассов, красное-подклассов.

Для e-value равного 1 в среднем видна тенденция уменьшения совпадения классификации для менее сходных по последовательности белков.




© Eugenia Zotova