Гомологичное моделирование комплекса белка с лигандом
  1. Полученные структуры лизоцима моллюска Meretrix lusoria

Остов белка у разных моделей отличается несильно, сильно различаются в основном торчащие наружу радикалы.



  1. Наложение одной из моделей лизоцима моллюска Meretrix lusoria на лизоцим форели.

Лизоцим форели - малиновый, моллюска - зеленый. Можно увидеть, что в лизоциме моллюска отсутствует целая альфа-спираль.



  1. Проверка качества моделей

Для моделей от 1 - 5 проверялось наличие аномальных уголв.


    Номер модели  Количство углов  Z-score
	1             18               1.310
	2             25               1.356
	3             22               1.330
	4             29               1.443
	5             22               1.343


	

Для моделей от 1 - 5 проверялось наличие аномальных длин связей.



    Номер модели  Количство связей  Z-score
	1             0                 0.960
	2             0                 0.970
	3             0                 0.978
	4             0                 0.950
	5             0                 0.971


	



© Eugenia Zotova