Анализ метаболического пути
В качестве метаболического пути для анализа был выбран путь биосинтеза лизина. Референсный путь достаточно разветвлен, что показано на картинке выше. Для дальнейшего анализа была выбрана реакция, показанная красным ниже.
N-ацетилдиаминопимелат деацитилаза катализирует реакцию гидролитического отцепления ацетата с образованием диаминопимелата, из которого в дальнейшем может синтезироваться лизин. Реакция показана ниже.
3.5.1.47: N-ацетилдиаминопимелат деацитилаза
3.5.1: гидролазы, катализирующие реакции линейных аминов
3.5: гидролазы, ведущие реакцию по связи N-C
3: гидролазы
Метаболический путь для Bacillus subtilis:
Организм несет 14 ферментов, катализирующих биосинтез лизина, и 16 генов. Это связано с тем, что ожин фермент представлени в трех изоформах.
Метаболический путь для Aspergillus flavus
