Для поиска блоков был выбран домен Acylglycerol kinase C-terminal (C-концевой домен ацилглицеролкиназы) с AC: PF19712, ID: AGK_C, seed: 20 и full: 493.
Ссылка на файл jvp с выравниванием
Найденный плюс-блок имеет координаты: 234 - 256. Паттерн: [IE]D.[EK][ELD][YP]E[AN][VMLN].[VLI][ESQD][LVI].[VLP][LW][PL][RWK][KP][LS].[FLQH][FLH]. Большая часть позиций этого блока высококонсервативны, он не имеет гэпов, при поиске паттерна, все найденные последовательности находятся в пределах данного блока.
Найденный частичный плюс-блок имеет координаты: 179 - 190. Паттерн: [DSG].[IFSLV][STGP][KV][GAMRSQ].[FY][IVL].[ATILVR][GA]. Большая часть позиций этого блока консервативны, он не имеет гэпов, при поиске паттерна, все найденные последовательности находятся в пределах данного блока. К нему относятся верхние 19 последовательностей данного выравнивания.
Найденный минус-блок имеет координаты: 87 - 94. Внутри него не получается выделить частичные плюс-блоки.