Практикум 1. Филогенетическое дерево.

Отобранные бактерии

Название Мнемоника
Arthrobacter sp. ARTS2
Bifidobacterium longum BIFLO
Clavibacter michiganensis CLAMS
Leifsonia xyli LEIXX
Mycolicibacterium vanbaalenii MYCVP
Rhodococcus jostii RHOJR
Streptomyces avermitilis STRAW

Скобочная формула

(((((LEIXX, CLAMS), ARTS2), BIFLO), STRAW), (MYCVP, RHOJR));

Изображение дерева

Ветви дерева

Дерево содержит 4 нетривиальные ветви:

  1. {LEIXX, CLAMS} против {ARTS2, BIFLO, STRAW, MYCVP, RHOJ}
  2. {ARTS2, LEIXX, CLAMS} против {BIFLO, STRAW, MYCVP, RHOJ}
  3. {ARTS2, LEIXX, CLAMS, BIFLO} против {STRAW, MYCVP, RHOJ}
  4. {ARTS2, LEIXX, CLAMS, BIFLO, STRAW} против {MYCVP, RHOJ}

Таксоны бактерий

Название Таксоны
Arthrobacter sp. Actinobacteria; Actinomycetia; Micrococcales; Micrococcaceae
Bifidobacterium longum Actinobacteria; Actinomycetia; Bifidobacteriales; Bifidobacteriaceae
Clavibacter michiganensis Actinobacteria; Actinomycetia; Micrococcales; Microbacteriaceae
Leifsonia xyli Actinobacteria; Actinomycetia; Micrococcales; Microbacteriaceae
Mycolicibacterium vanbaalenii Actinobacteria; Actinomycetia; Corynebacteriales; Mycobacteriaceae
Rhodococcus jostii Actinobacteria; Actinomycetia; Corynebacteriales; Nocardiaceae
Streptomyces avermitilis Actinobacteria; Actinomycetia; Streptomycetales; Streptomycetaceae

Ветви

  • {LEIXX, CLAMS} соответсвует Microbacteriaceae
  • {ARTS2, LEIXX, CLAMS} соответствует таксону Micrococcales
  • {MYCVP, RHOJR} соответсвует Corynebacteriales