Практикум 11

Краткое описание семейства доменов

Для работы было выбрано семейство response regulator aspartate phosphatase H, N terminal Таблица с данными о семействе доменов


Домен представляет из себя 3-х спиральную структуру на N конце регулятора ответа аспартат фосфатазы.
Домен распространен у бактерий, а также встречается у некоторых вирусов.

Описание выравнивания seed


Максимально достоверные блоки, включающие все последоваельности, отсутствуют. Максимально достоверный блок, влючающий не все последовательсти: 49-52. Также достоверна аминокислота в позиции 14.
Нет никаких достоверных подблоков на следующих участках: 19-22; 34-36.
Выравнивание в JalView

Карта локального сходства

dot-plot
Рисунок 1. Карта локального сходства.

Как видно из рис.1 белки очень схожи, что говорит о родстве организмов, из которых они получены.

Информация о выбранных белках