Для исследования я хотел выбрать Дозорщика-императора (одна из самых крупных стрекоз России). Однако, поиск по запросу "Anax imperator (emperor dragonfly)" не дал никаких результатов, поэтому я выбрал cборку для Тонкохвоста изящного (Ischnura elegans),так как она первая наиболее аннотированная по запросу "Odonata".
Тонкохвосты - это мелкие или очень мелкие стрекозы с тонким брюшком и прозрачными крыльями. Распространены по всей европейской части России. Данных о числе хромосом найти не удалось.
Уровень сборки (ioIscEleg1.1 ) - хромосомный.RefSeq | GenBank | |
Сборка | GCF_921293095.1 | GCA_921293095.1 |
Размер генома, п.н. | 1 700 000 000 | 1 000 000 000 |
Число хромосом | 14 | 14 |
Число органелл | 0 | 1 |
Число скэффолдов | 110 | 110 |
N50 скэффолдов, Mb | 123.6 | 123.6 |
L50 скэффолдов | 7 | 7 |
Число контигов | 359 | 359 |
N50 контигов, Mb | 13.1 | 13.1 |
L50 контигов | 36 | 36 |
N50 - размер контига, для которого 50% нуклеотидов сборки содержатся в контигах такой же и большей длинны. L50 - наименьшее число контигов, содержащее 50% нуклеотидов (для скэффолдо аналогично).
То что сборка аннотирована и анализ BUSCO показывает её высокое качество, позволяет сказать что сборка отражает биологическую информацию о геноме выбранного организма.
GCF_921293095.1_ioIscEleg1.1_genomic.fna.gz - нуклеотидные последовательности генома
GCF_921293095.1_ioIscEleg1.1_genomic.gbff.gz - последовательности генома с аннотацией
GCF_921293095.1_ioIscEleg1.1_protein.faa.gz - последовательности белков
Описание стрекозы согласно сайту ecosystema.ru