Указания к занятию 3

1. Первое задание не должно вызвать затруднений.
    
2.   Чтобы посмотреть описание конкретного поля и проиндексированные в SRS значения, можно поступить двумя способами:
   1. На странице Library Page кликните по названию интересующего вас банка (в данном случае это "UniprotKB/Swiss-Prot"). Появится страница с кратким описанием этого банка; ниже на той же странице найдёте список проиндексированных полей. Кликая по названию поля, получаете краткое описание поля (невредно на этом описании задержаться!) и окошко "List values that match...". Дальше соображайте сами (звёздочка, как всегда, заменяет любое количество любых букв), а если ничего не приходит в голову, спрашивайте у преподавателей.
   2. На ту же страничку с описанием конкретного поля можно выйти и другим способом, который часто бывает удобнее: на странице Library Page поставьте галочку в checkbox против нужного банка, затем нажмите кнопку "Standard Query Form". Откроется страница с формой запроса — основным рабочим инструментом пользователя SRS. В любом из четырёх меню под шапкой "Fields you can search " можно выбрать нужное поле, а затем нажать кнопочку "  " левее меню.
   
    
3.   Выйдите на страницу с формой запроса (см. чуть выше), выберите в меню нужное поле, а в окошко правее внесите свой запрос. Если вы не ошиблись, появится список находок в виде таблицы (в данном случае в ней всего одна строка), а сверху, в окошке "Query" — "перевод" вашего запроса на "язык SRS" (этот самый "перевод" в задании и называется "строка запроса", именно её Вам нужно копировать в таблицу 3). Кроме того, приведено количество находок.

   Чтобы сохранить находку в том или ином формате, найдите (в левой части страницы) и нажмите кнопку "Save". На открывшейся страничке выберите: в разделе "Output To:" — "File (text)", в разделе "Save As:", в меню "Save with view:" — "FastaSeqs" (остальное не меняйте), после чего нажмите "Save" и далее поступайте согласно здравому смыслу (т.е., сохраняйте в свою рабочую директорию, а потом переименуйте файл, если надо).
    

4.   Имеет смысл вносить слова из описания Вашего белка по одному, разделяя их оператором "И" (например, вместо "RNA polymerase" написать "RNA&polymerase").

   На странице с формой запроса пользуйтесь разделами "Result Display Options" и "Create a view". Получив требуемую таблицу, сохраните её как таблицу (та же кнопка "Save"; созданный Вами формат, скорее всего, получит кличку "SWISSPROT" и будет стоять по умолчанию), а добытый файл импортируйте в Excel (откуда уже несложно копировать информацию в таблицы Word).