Указания к занятию 1

1. Как добыть нужный документ UniProt?

   Пусть код доступа (AC) вашей записи P0X000 (разумеется, везде надо будет подставлять данный Вам AC).

   В адресную строку браузера введите следующий URL: http://www.uniprot.org/uniprot/P0X000.txt
   В основном окне появится текст записи. Сохраните его (посредством меню Page/File→Save As или просто скопируйте содержимое окна браузера в редактор).

    

2.   Описание полей и их меток см. здесь.

    

3. Как пользоваться поиском по UniProt?

   Зайдите на сайт UniProt:
   http://www.uniprot.org/
   В верхней части страницы увидите Search in...Query...
   В окошке Search in выберите UniProtKB, а в окошко Query введите запрос — одно или несколько слов из описания вашего белка, нажмите "Search".
   Если вы хотите искать словосочетание, то заключите его в кавычки: "например так"
   

   В верхней части страницы с результатами поиска найдите информацию о числе находок.
   Выберите один из белков, перейдите на его страницу по гиперссылке его Accession
   Эта гиперссылка ведет на html-страничку, содержащую информацию из записи, оформленную в специальном "дружественном к пользователю" виде. Имеет смысл изучить такую страничку и возможности, там предоставленные.
   Получить запись в TXT формате можно будет,перейдя по соответствующей ссылке справа в верхней части записи.

   Рекомендуется (особенно если описание вашего белка длинное, включает несколько синонимов и/или выражения вида "EC 1.2.1.17") попробовать несколько запросов и отразить это в отчётной таблице.

   Для информации.

   – В поле DE есть подполя: RecName, AltName и другие. Если описываемый белок является ферментом, то одним из синонимов будет код фермента согласно международной классификации (EC).