Kodomo

Пользователь

Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2015

Язык R и его применение в биоинформатике

Ведомость

[https://www.rstudio.com/products/rstudio/|RStudio]]

Система для выполнения домашних заданий После регистрации пишите на fbbrcourse [собака] gmail.com, чтобы мы добавили вас в группу, тогда станут доступны домашние задания.

[Шпаргалка по функциям]

Занятия

1. 1 сентября. Введение. Знакомство с R-Studio. Базовый тип - вектор, dataframe. Графики.

Tutorial

2. 8 сентября. Графика. Отсутствующие данные. Матрицы. Списки.

Лекция 2

Tutorial

3. 22 сентября. Факторы. Файлы. Статистика.

[лекция3]

Tutorial

4. 29 сентября. Манипуляции с данными, dplyr. Создание отчетов, markdown

[лекция4]

Tutorial dplyr

Tutorial markdown

5. 6 октября. Тесты ассоциации, GWAS. if, for, apply, merge

лекция5

Tutorial

old L3

6. 13 октября. Преобразование данных (reshape2). Графика (ggplot2). Чистка данных.

лекция6

Tutorial

7. 20 октября. Линейные модели часть 1

лекция7

Tutorial

8. 27 окт. Контрольная работа

[Файлы к контрольной работе]

9. 3 ноя. Линейные модели часть 2

лекция8

Датасет с ноутбуками

Датасет - паттерны эпигенетических модификаций в промоторах и энхансерах

Tutorial

10. 10 ноя. Множественное тестирование, кластеризация.

Tutorial

11. 17 ноя. Методы понижения размерности.

Tutorial

12. 24 ноя. Классификаторы.

Tutorial

13. 1 декабря. BioconductoR, дифференциальная экспрессия по данным RNA-seq

14. 8 декабря Gene Ontology. Технология Shiny.

[Gene Ontology]

[Технология Shiny]

Tutorial go

15. 15 декабря. Контрольная работа 2 [Файлы к контрольной работе]