2023
2022
2021
2020
2019
2017
2016
2015
Практикум 5. Заготовка отчета
1 <main>
2 <h2 class="prac_title">
3 #FIXME Название практикума. <!-- например, "Знакомство с UniProt" -->
4 </h2>
5
6 <p class="prac_intro">
7 #FIXME Краткое описание практикума.
8 </p>
9
10 <section class="basic_task">
11 <h3 class="task_title">#FIXME Заголовок 1. <!-- например, "Получение информации о белке NNN_MMMMM" --></h3>
12
13 <p class="task_intro">
14 #FIXME Краткое описание того, что было сделано. <!-- обязательно вставьте ссылку на таблицу, например, "Полученная информация представлена в таблице 1" -->
15 </p>
16
17 <table class="task_table">
18 <caption>
19 <span class="table_number">
20 Таблица 1.
21 </span>
22 Основная информация о белке #FIXME[UniProt ID вашего белка] из UniProt.
23 </caption>
24 <!-- горизонтальный вариант таблицы, ниже есть вертикальный, выбирайте любой, второй удалите -->
25 <tbody>
26 <tr>
27 <th class="column_header">UniProt ID</th>
28 <th class="column_header">UniProt AC</th>
29 <th class="column_header">RefSeq ID</th>
30 <th class="column_header">PDB ID</th>
31 <th class="column_header">Длина белка (а.о.)</th>
32 <th class="column_header">Молекулярная масса (Да)</th>
33 <th class="column_header">Рекомендуемое название</th>
34 </tr>
35 <tr>
36 <td>#FIXME</td>
37 <td>#FIXME</td>
38 <td>#FIXME</td>
39 <td>#FIXME</td>
40 <td>#FIXME</td>
41 <td>#FIXME</td>
42 <td>#FIXME</td>
43 </tr>
44 </tbody>
45 <!-- вертикальный вариант таблицы
46 <tbody>
47 <tr>
48 <th class="row_header">UniProt ID</th>
49 <td>#FIXME</td>
50 </tr>
51 <tr>
52 <th class="row_header">UniProt AC</th>
53 <td>#FIXME</td>
54 </tr>
55 <tr>
56 <th class="row_header">Название белка</th>
57 <td>#FIXME</td>
58 </tr>
59 <tr>
60 <th class="row_header">RefSeq ID</th>
61 <td>#FIXME</td>
62 </tr>
63 <tr>
64 <th class="row_header">PDB ID</th>
65 <td>#FIXME</td>
66 </tr>
67 <tr>
68 <th class="row_header">Длина белка (а.о.)</th>
69 <td>#FIXME</td>
70 </tr>
71 <tr>
72 <th class="row_header">Молекулярная масса (Да)</th>
73 <td>#FIXME</td>
74 </tr>
75 <tr>
76 <th class="row_header">Рекомендуемое название</th>
77 <td>#FIXME</td>
78 </tr>
79 </tbody> -->
80 </table>
81
82 <p class="task_info">
83 </p>
84
85 <p class="task_outro">
86 #FIXME Комментарий к таблице 1. <!-- про цепи и представленность в PDB и т.д., здесь же можете прокомментировать в целом задание 1, ваши впечатления от UniProt, или ещё что-то. -->
87 </p>
88
89 </section>
90
91 <section class="basic_task">
92 <h3 class="task_title">#FIXME Заголовок 2. <!-- например, "Поиск белка NNN_MMMMM в UniRef" --></h3>
93
94 <p class="task_intro">
95 #FIXME <!--Что и для чего было сделано, опять нужна ссылка на таблицу.-->
96 </p>
97
98 <table class="task_table">
99 <caption>
100 <span class="table_number">
101 Таблица 2.
102 </span>
103 Кластеры UniRef, содержащие белок #FIXME[UniProt ID вашего белка].
104 </caption>
105 <!-- горизонтальный вариант таблицы, ниже есть вертикальный, выбирайте любой, второй удалите -->
106 <tbody>
107 <tr>
108 <th class="column_header">Раздел UniRef</th>
109 <th class="column_header">ID кластера</th>
110 <th class="column_header">Название кластера</th>
111 <th class="column_header">Размер кластера</th>
112 </tr>
113 <tr>
114 <th class="row_header">UniRef100</th>
115 <td>#FIXME</td>
116 <td>#FIXME</td>
117 <td>#FIXME</td>
118 </tr>
119 <tr>
120 <th class="row_header">UniRef90</th>
121 <td>#FIXME</td>
122 <td>#FIXME</td>
123 <td>#FIXME</td>
124 </tr>
125 <tr>
126 <th class="row_header">UniRef50</th>
127 <td>#FIXME</td>
128 <td>#FIXME</td>
129 <td>#FIXME</td>
130 </tr>
131 </tbody>
132 <!-- вертикальный вариант таблицы
133 <tbody>
134 <tr>
135 <th class="column_header"></th>
136 <th class="column_header">UniRef100</th>
137 <th class="column_header">UniRef90</th>
138 <th class="column_header">UniRef50</th>
139 </tr>
140 <tr>
141 <th class="row_header">ID кластера</th>
142 <td>#FIXME</td>
143 <td>#FIXME</td>
144 <td>#FIXME</td>
145 </tr>
146 <tr>
147 <th class="row_header">Название кластера</th>
148 <td>#FIXME</td>
149 <td>#FIXME</td>
150 <td>#FIXME</td>
151 </tr>
152 <tr>
153 <th class="row_header">Размер кластера</th>
154 <td>#FIXME</td>
155 <td>#FIXME</td>
156 <td>#FIXME</td>
157 </tr>
158 </tbody> -->
159 </table>
160
161 <p class="task_outro">
162 #FIXME Комментарий к таблице 2 и/или ко всему заданию. <!-- опять можете описать ваши впечатления, теперь от UniRef -->
163 </p>
164
165 </section>
166
167 <section class="basic_task">
168 <h3 class="task_title">#FIXME Заголовок 3. <!-- например, "Сеансы поиска в UniProt" --></h3>
169
170 <p class="task_intro">
171 #FIXME <!--Что и для чего было сделано. Что-то типа "для знакомства с синтаксисом запросов в UniProt были проведены следующие сеансы поиска."-->
172 </p>
173
174 <!-- Этот раздел можете оформлять на свое усмотрение, в виде таблицы, списка, просто текстом, или еще как-то. Но очень желательно, чтобы его можно было проверять, не проклиная Вас =). Ниже просто не самый плохой из вариантов. -->
175
176 <h4 class="task_subtitle">Поиск #FIXME[название белка в родительном падеже]</h4>
177 <ul>
178 <li>
179 <h5>Описание запроса</h5>
180 <p>
181 Текст запроса: <kbd>#FIXME[текст запроса, желательно в кавычках]</kbd> <br />
182 Количество находок в Swiss-Prot: #FIXME <br />
183 Общее количество находок: #FIXME <br />
184 </p>
185 </li>
186
187 <li>
188 <h5>Описание запроса</h5>
189 <p>
190 Текст запроса: <kbd>#FIXME[текст запроса, желательно в кавычках]</kbd> <br />
191 Количество находок в Swiss-Prot: #FIXME <br />
192 Общее количество находок: #FIXME <br />
193 </p>
194 </li>
195
196 ...
197 </ul>
198
199 <h4 class="task_subtitle">Поиск #FIXME[альбуминов/гистонов/иличтовытамвыбрали]</h4>
200 <ul>
201 <li>
202 <h5>Описание запроса</h5>
203 <p>
204 Текст запроса: <kbd>#FIXME[текст запроса, желательно в кавычках]</kbd> <br />
205 Количество находок в Swiss-Prot: #FIXME <br />
206 Общее количество находок: #FIXME <br />
207 </p>
208 </li>
209
210 <li>
211 <h5>Описание запроса</h5>
212 <p>
213 Текст запроса: <kbd>#FIXME[текст запроса, желательно в кавычках]</kbd> <br />
214 Количество находок в Swiss-Prot: #FIXME <br />
215 Общее количество находок: #FIXME <br />
216 </p>
217 </li>
218
219 ...
220 </ul>
221
222 <h4 class="task_subtitle">Поиск трипсинов</h4>
223 <ul>
224 <li>
225 <h5>Поиск по слову "трипсин"</h5>
226 <p>
227 Текст запроса: <kbd>#FIXME[текст запроса, желательно в кавычках]</kbd> <br />
228 Количество находок в Swiss-Prot: #FIXME <br />
229 Общее количество находок: #FIXME <br />
230 </p>
231 </li>
232
233 <li>
234 <h5>Поиск трипсинов, исключая их ингибиторы</h5>
235 <p>
236 Текст запроса: <kbd>#FIXME[текст запроса, желательно в кавычках]</kbd> <br />
237 Количество находок в Swiss-Prot: #FIXME <br />
238 Общее количество находок: #FIXME <br />
239 </p>
240 </li>
241 </ul>
242
243 <p class="task_outro">
244 #FIXME Комментарий к результатам поиска.
245 </p>
246
247 </section>
248
249 <!-- Заготовка для дополнительных заданий -->
250 <!-- section class="suppl_task">
251 <h3 class="task_title">#FIXME Заголовок.</h3>
252
253 <p class="task_intro">
254 #FIXME Что и для чего было сделано.
255 </p>
256 <p class="task_info">
257 #FIXME Описание результатов.
258 </p>
259 <p class="task_outro">
260 #FIXME Выводы, комментарии, обсуждение, etc.
261 </p>
262 </section -->
263
264 <!-- p class="prac_outro">
265 #FIXME Какие-то выводы и/или впечатления по практикуму в целом, опционально.
266 </p -->
267
268 </main>