Тактика решения 5-го задания практикума 1

Оценим координаты начала и конца гена: [28200;28400] и [29400;29600] соответственно. Область [28400;29400] точно лежит внутри гена, ищем там стоп-кодоны. Допустим, TGA. Эти кодоны находятся только в рамках считывания 0 и 1 (остаток от деления координаты начала на 3). Значит, искомые старт-кодон и стоп-кодон лежат в рамке считывания 2 (иначе бы трансляция закончилась раньше времени).

В [28200;28400] есть единственный AUG в рамке считывания 2. Стоп-кодоны TGA в [29400;29600] есть только в рамках считывания 1 и 0, а вот первый TAA в [29400;29600] оказывается в рамке считывания 2. Все TAG находятся дальше этого TAA, поэтому этот TAA - искомый стоп-кодон. Координата начала AUG и координата конца TAA - 28274 и 29533 соответственно.

Готово!