Практикум 4

Переброска файла на свой компьютер

darfil@kodomo:~$ cd /P/y20/term1/pr4/images 
darfil@kodomo:/P/y20/term1/pr4/images$ cp darfil ~/term1/block1/pr4
darfil@kodomo:~/term1/block1/pr4$ mv darfil Filippova_image.jpeg
darfil@kodomo:~/term1/block1/pr4$ mv Filippova_image.jpeg ~/term1/block1/credits
C:\Users\User>sftp darfil@kodomo.fbb.msu.ru get Filippova_image.jpeg

На картинке изображены симпатичные палеозойские головоногие моллюски.

Работа с масками файлов и перенаправлениями

darfil@kodomo:/P/y20/term1/pr4/files$ ls | wc -w
88 

- количество файлов в директории

darfil@kodomo:/P/y20/term1/pr4/files$ ls | grep .txt -c
14

- количество файлов в формате .txt

darfil@kodomo:/P/y20/term1/pr4/files$ cat *.fasta > /home/students/y20/darfil/term1/block1/credits/Filippova_all.fasta

- вывод содержимого всех файлов .fasta в зачетный файл

Программа grep

darfil@kodomo:~/term1/block1/credits$ grep '^>' Filippova_all.fasta > /home/students/y20/darfil/term1/block1/credits/Filippova_all.names

- получение зачетного файла.

darfil@kodomo:/P/y20/term1/pr4/files$ grep -c "^>" *.fasta
1.fasta:1
Xax229_230.fasta:2
pan1_mouse.fasta:1
pan3_mouse.fasta:1

- строчки, содержащие > в начале.

darfil@kodomo:/P/y08/Term_5/Materials$ grep ^ATOM 1GT0.pdb | grep -c HIS
30

- дополнительное задание с гистидином.

правка от 02.10.2020 - формат приведен в соответствие с озвученным на лекции, содержание не изменено.