Практикум 4

Задание 1

• Для скачивания файла я воспользовалась программой WinCP. Сперва я подключилась к серверу kodomo, затем нашла необходимый файл, затем скопировала его в свою директорию на сервере и переименовала его в формат jpeg. После чего скопировала на свой компьютер и открыла. На рисунке изображен мужчина вида Homo sapiens.

Задание 2

• Я не смогла выбрать подходящую свою фотографию. Поэтому загрузила фотографию жабки за компьютером. Мне кажется она хорошо отображает моё состояние на занятиях по биоинформатике.

Задание 3

1. В папке /P/y20/term1/pr4/files 88 файлов. Я получила это число с помощью перенаправления выхода функции ls на вход функции wc:

   • kmd@kodomo:/P/y20/term1/pr4/files$ ls | wc

2. В папке /P/y20/term1/pr4/files 14 файлов, заканчивающихся на .txt. Я получила это число с помощью перенаправления выхода функции ls c аргументом *.txt на вход функции wc:

   • wc.kmd@kodomo:/P/y20/term1/pr4/files$ ls *.txt | wc

3. Я получила необходимый результат, используя команду cat:

   • kmd@kodomo:/P/y20/term1/pr4/files$ cat *.fasta > ~/term1/block1/credits/Korlyakova_all.fasta

Задание 4

1. grep '^>' Korlyakova_all.fasta > Korlyakova_all.names

2. Ответ: 1.fasta:1 Xax229_230.fasta:2 pan1_mouse.fasta:1 pan3_mouse.fasta:1

   Я получила ответ с помощью использования опции -c функции grep:

   • kmd@kodomo:/P/y20/term1/pr4/files$ grep -c '>' *.fasta

3. kmd@kodomo:/P/y08/Term_5/Materials$ grep -c "^ATOM.*HIS" 2B5A.pdb

   • Ответ: 80 гистидинов в белке