Содержимое страницы «Users/smirnovm/pr4».

Практикум 4

Задание 1

• подключился к кодомо по sftp
• зашел в директорию с файлом
• скопировал файл на свой компьютер с помощью get На картинке я увидел симпатичных существ, похожих на крокодилов, на фоне пустынной местности

Задание 2

Тут я на даче

Задание 3

Сколько файлов на kodomo в папке /P/y20/term1/pr4/files

• 88

  ls /P/y20/term1/pr4/files | wc

Сколько этих файлов имеют имена, заканчивающиеся на .txt

• 14
• сделал файл fles.txt в pr4 со списком файлов в /P/y20/term1/pr4/files

ls /P/y20/term1/pr4/files > fles.txt

• и с помощью grep посчитал сколько строк заканчиваются на .txt

grep -c '.txt$' fles.txt

* напишите, какой командой вы получили этот файл

smirnovm@kodomo:/P/y20/term1/pr4/files$ cat *.fasta > ~/term1/block1/credits/Smirnov_all.fasta

Задание 4

• Создайте в директории credits файл Xxxx_all.names, состоящий из строк файла Xxxx_all.fasta, начинающихся на знак ">" (это имена последовательностей, описанных в fasta-файле). На wiki-странице /pr4 напишите, какой командой вы получили этот файл.

smirnovm@kodomo:~/term1/block1/credits$ grep '^>' Smirnov_all.fasta > Smirnov_all.names

• Для каждого из файлов в директории /P/y20/term1/pr4/files, чьё имя заканчивается на .fasta, напишите, сколько в нём строк начинается на ">". На wiki-странице /pr4 напишите, с помощью какой команды вы получили эту информацию.

smirnovm@kodomo:/P/y20/term1/pr4/files$ grep -c '^>' *.fasta

ответ убил

1.fasta:1
Xax229_230.fasta:2
pan1_mouse.fasta:1
pan3_mouse.fasta:1